OpenAI, PerturbAI y Scripps Research han utilizado cerca de 2000 agentes de IA para analizar un gran conjunto de datos de cerebro de ratón en 32 minutos.
El equipo estima que los investigadores que trabajaran a mano necesitarían de meses a un año para mismo análisisque OpenAI publicó el miércoles.
Los agentes siguieron corriendo GPT-Rosalind de OpenAIun modelo creado para la investigación en ciencias biológicas. Los resultados se exponen en un preimpresión de bioRxivque aún no ha sido revisado por pares.
Los datos provienen de un atlas CRISPR de todo el cerebro construido por PerturbAI. CRISPR es una herramienta de edición de genes, y aquí se utilizó para desactivar genes individuales en ratones, mostrando cómo cada cambio afecta a diferentes tipos de células cerebrales.
Cada agente tomó uno de estos cambios genéticos. Estudió cómo respondían las células, buscó en la literatura científica y sugirió posibles explicaciones.
Luego, el equipo fusionó todos los informes en un único atlas de razonamiento que vincula genes, efectos celulares, artículos y mecanismos probables.
Según OpenAI, los agentes reprodujeron hallazgos de análisis humanos anteriores y también encontraron nuevas pistas. En las pruebas ciegas, los expertos prefirieron los informes de este enfoque dividido a los de un solo agente el 75% de las veces.
El enfoque dividido también tuvo una lectura más amplia. En la mayor carga de trabajo, los numerosos agentes citaron juntos más de 700 referencias, en comparación con 11 para un solo agente.
Una pista involucra dos genes, Tsc1 y Tsc2, que ayudan a controlar el crecimiento celular. La desactivación de Tsc2 cambió docenas de genes relacionados con la comunicación entre las células nerviosas del cerebelo, mientras que la desactivación de Tsc1 cambió poco. Esa brecha puede ser importante para la esclerosis tuberosa, un trastorno genético poco común.
En otro caso, desactivar Dctn1, un gen vinculado a la rara enfermedad cerebral síndrome de Perry, aumentó la actividad de los genes que producen colesterol. Los agentes sugirieron realizar experimentos de laboratorio para comprobar si esto influye en el daño a las células nerviosas.
«Construimos atlas celulares para que otros científicos puedan hacer descubrimientos que aún no hemos imaginado», dijo Sarah Teichmann, catedrática de medicina con células madre en la Universidad de Cambridge.
El atlas de razonamiento ahora está disponible en GitHub y el conjunto de datos subyacente está en Hugging Face.